Lammps程序PPT0.ppt

Lammps程序关于lammps基础知识(1)Initialization（2）Atomdefinition(3)SettingsSupplimentfixIDgroup−IDstyleargs·ID=user−assignednameforthefixID是用自己定义的名字，便于通过fix定义·group−ID=IDofthegroupofatomstoapplythefixto·style=oneofalonglistofpossiblestylenames(seebelow)·args=argumentsusedbyaparticularstyleExamples:fix1allnvefix3allnvttemp300.0300.00.01fixminetopsetforce0.0NULL0.0对于run100start0stop1000这个语句来说，主要与fix语句配合使用。fix1allnvt200.0300.01.0这两个指令的功能是在接下来的1000步运行中，每run100步，温度都要从200度升到300度Every的作用是将一个run分成一系列较短的runsvariableqequalxrun6000every2000"printCoord=$q"每运行2000步输出一次某原子的x坐标值要设定一组原子的温度,那么用group命令定义哪些原子属于这个组才行;每个命令的详细介绍中的Restrictions部分会说明要使用该命令定义的时候哪些命令必须要被预先定义;如果你的输入文件书写的格式有问题,lammps在执行的时候会提示ERROR或者WARNING,出现类似信息时,你可以到手册的第九章中查询原因;(4)RunasimulationCommandslistedbycategoryInitialization:atom_modify,atom_style,boundary,dimension,newton,processors,units;Atomdefinition:create_atoms,create_box,lattice,read_data,read_restart,region,replicate;Forcefields:angle_coeff,angle_style,bond_coeff,bond_style,dielectric,dihedral_coeff,dihedral_style,improper_coeff,improper_style,kspace_modify,kspace_style,pair_coeff,pair_modify,pair_style,pair_write,special_bonds;Settings:communicate,dipole,group,mass,min_modify,min_style,neigh_modify,neighbor,reset_timestep,run_style,set,shape,timestep,velocity;Fixes:fix,fix_modify,unfix;Computes:compute,compute_modify,uncompute;Output:dump,dump_modify,restart,thermo,thermo_modify,thermo_style,undump,write_restart;Actions:delete_atoms,delete_bonds,displace_atoms,displace_box,minimize,run,temper;Miscellaneous:clear,echo,if,include,jump,label,log,next,print,shell,variable.Lammps中特殊符号含义(5)一行中第一个词是命令名,后续的词是相关的参数.(6)双引号内的文字空格被整体地当作一个参数,其中的#或$就没有前面说的作用了.PureCucrystaltemperature=degreesK温度pressure=bars压力dynamicviscosity=Poise动力学粘性系数：泊charge=multipleofelectroncharge(+1.0isaproton)电荷：电荷整数倍dipole=charge*Angstroms偶极矩electricfield=volts/Angstromdensity=gram/cm^dimtorque=eV力矩atom_stylecharge原子属性：带电粒子系统dimension3维数：3boundaryppp边界条件：pisperiodicp指周期性fisnon-periodicandfixed：固定非周期sisnon-p