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计算机辅助药物设计(CADD)分类二、药物作用的基本理论1.受体学说及药物-受体相互作用的方式和本质作用方式:亲和力和内在活性学说—先形成复合物,再引发受体产生内在活性。 激动剂;部分激动剂;拮抗剂 对占领学说的补充和修正 无法说明激动剂与拮抗剂和受体结合产生相反效应(分子水平) 绞链学说—受体由特异性和非特异性二部份组成。激动剂、拮抗剂均可与特异性部位结合,具可逆性。但拮抗剂还可与非特异性部位结合,且结合力较强。 解释了加入过量的激动剂也不能将拮抗剂除去速率学说—生物效应与单位时间内药物分子和受体相结合的总数成正比。 不能在分子水平解释结构相似的药物有的是激动剂,有的是拮抗剂。 e.诱导契合学说—在与底物相互作用下,具有柔性和可塑性的酶活性中心被底物诱导发生构象变化而产生互补性结合。f.大分子微扰学说—药物与生物大分子相互作用时,药物对生物大分子的构象发生微扰作用,使二者有更好的互补性和适配性。 g.二态模型的占领-活化学说—未被药物占领的受体存在非活化态R和活化态R*,两种状态处于动态平衡。激动剂对活化态受体有较高亲和力,使平衡向R*方向移动;拮抗剂对于非活化态受体的亲和力强,平衡向R方向移动。2.药物-受体的相互作用力及其立体因素的影响12132).立体作用15163.药物的化学结构与生物活性的关系(SAR)基于受体分子的组成、性状及空间结构还未深入了解,对药物进行构效关系研究可间接地阐明药物的作用机理。 研究内容:药效、药动及毒性的构效关系。 得到药物的药效基团、药动基团和毒性基团 高效、低毒、安全 1).药效团 分子结构中产生活性或毒性的某些特定的基团。21222).药动团(1).天然氨基酸(2).磷酸基(3).糖基(4).胆酸(5).改变药动团的方法3).毒性基团此外,已知具有诱导细胞分化的药物,有影响胚胎的正常发育,造成胎儿畸型的毒性反应。如:治疗皮肤病和癌化学预防的维生素甲酸。 344).药效构象(pharmacophoricconformation)例:钙离子通道拮抗剂—硝苯地平维甲酸及其类似物的构象384.定量构效关系(QSAR)1).线性自由能相关方法Log1/C=-k1π2+k2π+k3σ+k4Es+ks理化参数的意义2).Free-Wilson模型5.三维定量构效关系(3D-QSAR)3D-QSAR的评价三、有关理论计算、技术和设备2.重要技术2).核磁共振技术NMR给出的结构信息主要有:3).其他结构分子生物学测定技术4).计算机分子模型技术计算机模型的表示方式有归纳起来计算机分子模型技术主要能提供以下信息:3.计算机硬件和软件软件和专家系统四、计算机辅助药物设计的意义2.计算机辅助药物设计的特征61五、计算机辅助药物设计的方法学2.全新药物设计(直接药物设计)主要方法:3.间接药物设计

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