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2024-11-22
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猕猴桃科与近缘科的古多倍化与基因家族进化
猕猴桃科(Actinidiaceae)是一个小型的被子植物科,在系统发育上被归入半脱落子目双盖花目(Campanulales),包括大约370个物种,主要在东南亚和太平洋岛屿地区分布。猕猴桃科所属的猕猴桃属(Actinidia)是该科中最著名的属,其中就包括了人们常吃的猕猴桃。
猕猴桃科与近缘科的古多倍化(Whole-genomeduplication)是指在起源历史较远的两个或多个类群之间发生的整个染色体组复制事件,最终导致了基因组的倍数增加。猕猴桃科中的大多数属都经历过古多倍化事件。虽然这种事件的确切时间尚未得到确定,但推断表明,其可能在约1亿7千5百万年前就已经发生了。据估计,猕猴桃科古多倍化事件导致了其基因组长度的增加,蛋白质编码基因数量和基因家族的扩张。
猕猴桃科所属的猕猴桃属(Actinidia)是研究基因家族进化的适合模式。由于近年来的大规模测序技术的进步和猕猴桃的基因组测序,我们可以更深入地了解猕猴桃属物种的基因家族。除了一些广泛分布的基因家族,例如NBS-LRR(toll/interleukin-1receptornucleotide-bindingsiteleucine-richrepeat)和MYB(Myeloblastosis)家族,猕猴桃属还拥有一些特异的基因家族,例如:猕猴桃花青素合酶(ActinidiaF3'H)和黄酮酸合酶(ActinidiaCHS)家族以及猕猴桃喷雾露组成基因家族等。
猕猴桃花青素合酶和黄酮酸合酶是植物次生代谢产物的有力合作桥梁。它们是两个互补的基因家族,在花青素合成和黄酮酸合成通路中起互补作用。花青素合成是由苯丙氨酸途径分支而来,通过花青素合酶催化生成花青素。而黄酮酸合成则从类黄酮开始,通过CHS催化合成花色苷酸,然后通过其他途径生成黄酮酸和异黄酮。在猕猴桃中,这两个基因家族的扩张可能是为了适应在大多数猕猴桃果实中高浓度的花青素和黄酮酸的需求。
猕猴桃喷雾露组成基因家族是另一个非常特殊的基因家族,主要负责产生猕猴桃喷雾露中的粘附蛋白,这些粘附蛋白是一种黏性物质,可以帮助猕猴桃在环境中生长并保护其表面,防止微生物和其他外来物质的入侵。
总之,猕猴桃科与近缘科的古多倍化事件是其基因组进化历史中非常重要的里程碑。基于该事件,猕猴桃科的基因组扩张和基因家族进化加速了许多,这让研究人员更深入地了解了基因家族的扩张和多样性,进而更好地了解植物发育和适应性进化的机制。
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