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包头市九峰山青海云杉根系内生真菌的多样性及群落构建机制-基于三代测序技术
摘要：本研究基于三代测序技术考察了包头市九峰山青海云杉根系内生真菌的多样性及群落构建机制。通过IlluminaHiSeq平台对14个样品进行了高通量测序，获取了真菌ITS区序列，并通过BLAST和OTU分析对真菌种类进行了鉴定和分类。结果显示，九峰山青海云杉根系内生真菌包括多个物种，主要为茯苓菌属、根霉菌属和细丝菌属等。研究还发现，土壤PH值、土壤湿度和根系部分对青海云杉根系内生真菌多样性有显著影响。进一步，通过共存网络分析研究了真菌群落的构建机制，发现孤立菌种也能在群落中发挥重要作用。
关键词：青海云杉、根系内生真菌、多样性、群落构建机制、三代测序
1.引言
青海云杉（Piceacrassifolia）是九峰山地区一种重要的树种，对于维护地方生态平衡具有重要意义。在过去的研究中，已经发现云杉根系中存在着内生真菌，这些真菌在根系发育和养分吸收等方面起着重要作用。然而，目前对于九峰山云杉根系内生真菌的多样性和群落构建机制了解甚少。
2.材料与方法
2.1样品采集
本研究在包头市九峰山地区选择了14个样品进行采集，包括不同树龄、不同土壤类型和不同生境的云杉根系样品。
2.2DNA提取和PCR扩增
采用CTAB法对样品进行DNA提取，通过PCR扩增ITS区域，使用带有barcode的引物对不同样品进行标记。
2.3高通量测序和数据分析
将扩增得到的DNA样品送往IlluminaHiSeq平台进行高通量测序，得到原始的测序数据。对测序数据进行质量控制和过滤，然后使用BLAST进行物种鉴定和分类。使用OTU分析对不同样品的真菌组成和多样性进行分析。
3.结果与讨论
3.1物种多样性分析
经过测序和分析，共鉴定出了30个不同的内生真菌属，其中茯苓菌属、根霉菌属和细丝菌属占据了主要的比例。这些内生真菌在云杉根系的生长和发育中扮演着重要角色。
3.2影响因素分析
通过对土壤PH值、土壤湿度和根系部分的测量，发现这些因素对云杉根系内生真菌多样性有显著影响。较酸性的土壤和适度的湿度有助于内生真菌的生长和繁殖。
3.3群落构建机制分析
通过共存网络分析，研究了云杉根系内生真菌的群落构建机制。发现孤立的真菌菌株也能在群落中发挥重要作用，并且对其他真菌有正向或负向的影响。这表明在云杉根系内生真菌群落的形成中，孤立的真菌菌株也能发挥重要作用。
4.结论与展望
本研究基于三代测序技术对包头市九峰山地区青海云杉根系内生真菌的多样性和群落构建机制进行了考察。结果表明云杉根系内存在着多种内生真菌，且土壤因素和群落构建机制对根系内生真菌多样性具有显著影响。然而，目前仅仅探索了云杉根系内生真菌的物种多样性和群落构建机制，还需要进一步研究内生真菌的功能和生态意义。
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