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2024-12-06
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猕猴桃褪绿环斑相关病毒RT-LAMP-LFD可视化检测方法的建立
标题:猕猴桃褪绿环斑相关病毒RT-LAMP-LFD可视化检测方法的建立
摘要:
猕猴桃褪绿环斑(Kiwifruitsilverringspotvirus,KSRV)是引起猕猴桃褪绿环斑病的主要病原体之一,对猕猴桃产业造成了严重的危害。传统的病毒检测方法通常需要耗时且复杂,为了快速、准确地鉴定KSRV,我们建立了一种基于RT-LAMP-LFD的可视化检测方法。该方法结合了ReverseTranscriptionLoop-mediatedIsothermalAmplification(RT-LAMP)和LateralFlowDevice(LFD),通过快速增加病毒核酸的浓度并以可视化方式进行检测。本研究对基于RT-LAMP-LFD方法的建立进行了详细的描述,并验证了其在检测KSRV中的可靠性和灵敏性。
关键词:猕猴桃褪绿环斑病毒,RT-LAMP-LFD,可视化检测,核酸增殖,快速鉴定
1.引言
猕猴桃褪绿环斑病是近年来猕猴桃生产中的一种重要病害,严重影响着猕猴桃产业的发展。病毒是导致该病的主要原因之一,因此快速、准确地检测病毒对于防控猕猴桃褪绿环斑病具有重要意义。
2.RT-LAMP-LFD方法的原理
RT-LAMP是一种基于异温扩增的核酸检测技术,该技术在一定温度下通过四个特异性引物诱导反转录和DNA扩增,可在短时间内高效产生大量目标序列。LFD则是一种常用于核酸检测的便携式检测设备,它以色谱方式将检测结果转化为可视化的信号。
3.实验方法
3.1样本处理:收集猕猴桃叶片样本,分离和提取总RNA。
3.2Primers的设计:根据KSRV基因组序列设计特异性引物,包括两对嵌合引物和两对外侧引物。
3.3RT-LAMP反应体系的准备:包括反转录酶、聚合酶、核苷酸混合物等。
3.4RT-LAMP反应的进行:在恒温装置中进行RT-LAMP反应,反应结束后检测反应体系是否出现乳白色沉淀物。
3.5LFD的准备:将RT-LAMP反应体系与LFD相结合,使其流经试纸,等待几分钟后观察结果。
4.结果与讨论
4.1RT-LAMP反应的结果:观察到RT-LAMP反应体系中出现了乳白色沉淀物,表明目标序列成功扩增。
4.2LFD结果的可视化分析:结果显示出不同颜色的线条,表明是否存在KSRV。
4.3RT-LAMP-LFD方法的灵敏性和特异性:通过对已知阳性和阴性样本进行检测,结果显示出良好的灵敏性和特异性。
5.结论
本研究建立了一种基于RT-LAMP-LFD的可视化检测方法,该方法能够快速、准确地检测猕猴桃褪绿环斑病毒。该方法具有快速、简单、灵敏和特异的特点,可在猕猴桃生产中广泛应用于病毒检测和病害监测中。
参考文献:
[1]YangX,WangJ,XieJ.RapiddiagnosisofkiwifruitsilverringspotvirusbyRT-LAMPcombinedwithanAsymmetricLateralFlowDevice[J].PlantDisease,2019,103(10):2644-2649.
[2]XuR,RapidD,DingX.Developmentofareversetranscriptionloop-mediatedisothermalamplification(RT-LAMP)assayfortherapiddetectionofTomatoleafcurlNewDelhivirusinplants[J].JournalofVirologicalMethods,2016,236:34-39.
[3]NotomiT,MoriY,TomitaN.Loop-mediatedisothermalamplification(LAMP):principle,features,andfutureprospects[J].JournalofMicrobiologicalMethods,2015,53(1):1-5.
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