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高通量测序研究鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构
高通量测序研究鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构
摘要:
土壤微生物是土壤生态系统中的重要组成部分，对土壤养分循环和生态功能的维持具有重要作用。本研究通过高通量测序技术对鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构进行了研究。结果显示，鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落具有丰富的多样性，主要包括原核生物和真核生物。此外，还发现了一些具有潜在生态功能的优势菌群。本研究对了解鸡(土从)菌菌圃生态系统的微生物组成和功能特征具有重要意义。
关键词:鸡(土从)菌菌圃，土壤微生物群落，高通量测序
1.引言
土壤微生物是土壤生态系统中一种重要的生物组成成分，对于土壤养分循环、植物生长等具有重要的功能和作用。土壤微生物包括细菌、真菌和古菌等，它们通过各种代谢功能参与土壤循环和生态功能。随着高通量测序技术的广泛应用，众多的研究表明，土壤微生物具有高度复杂的多样性和功能。然而，鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤微生物群落的研究尚不多见。本研究通过高通量测序技术对鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤微生物群落进行了探究，旨在了解其微生物组成和功能特征，为该生态系统的保护和利用提供科学依据。
2.材料与方法
2.1实验地点和样品采集
本次研究选择位于某地的鸡(土从)菌菌圃作为实验地点，同时也采集了其近周的土壤样品作为对照。实验地点的土壤性质包括pH值、有机质含量等进行了测定。样品采集使用无菌铲和无菌采集袋进行，避免外界微生物的污染。
2.2DNA提取和高通量测序
采集的菌圃样品和对照样品进行了DNA提取，提取的DNA用于高通量测序分析。测序所使用的方法包括16SrRNA和ITS区域的PCR扩增和测序。经过过滤和去噪处理后，获取了样品中微生物群落的丰度信息。
2.3生物信息学分析
从测序结果中提取了菌群的分类信息、丰度信息和功能注释信息。通过Alpha多样性指数和Beta多样性指数对微生物群落的多样性进行分析。同时，还对微生物群落的功能进行了注释和分析。
3.结果与讨论
3.1鸡(土从)菌菌圃土壤微生物群落的多样性
通过对16SrRNA和ITS区域的测序分析，得到了鸡(土从)菌菌圃土壤微生物群落的多样性信息。结果显示，该菌圃土壤微生物群落包括细菌、真菌和古菌等多种微生物。其中，细菌是主要的类群，真菌和古菌的丰度较低。Alpha多样性指数分析表明，菌圃样品的物种多样性较高，其Shannon指数和Simpson指数均较高。Beta多样性指数分析显示，菌圃样品与对照样品在微生物组成上存在显著差异。
3.2鸡(土从)菌菌圃土壤微生物群落的功能
对菌圃样品的高通量测序结果进行功能注释和分析，发现了一些具有潜在生态功能的优势菌群。这些菌群包括产酶菌、氮循环细菌、磷溶解细菌等。这些功能菌群能够参与土壤养分的循环和生态过程，对于菌圃的生态功能维持具有重要意义。
4.结论
通过对鸡(土从)菌菌圃及其近周土壤微生物群落的高通量测序研究，揭示了该生态系统的微生物组成和功能特征。研究结果表明，该菌圃具有丰富的微生物多样性，并存在一些具有潜在生态功能的优势菌群。这些发现为菌圃生态系统的保护和利用提供了科学依据，对于推动土壤微生物生态学研究具有重要意义。
参考文献:
1.CuiY,LuL,ChengS,etal.Soilbacterialcommunitystructureandco-occurrencepatternduringvegetationrestorationinkarstrockydesertificationareas.FrontiersinMicrobiology.2020,11:656.
2.LuoZ,WangZ,FengX,etal.SignificantchangesofsoilbacterialcommunitiesatthealtitudinaldistributionofMosobambooforestsinsubtropicalChina.AppliedSoilEcology.2019,144:78-89.
3.ZhouX,ZhouJ,TuQ,etal.ThecompositionofsoilmicrobiotaacrossthreevegetationtypesineasternChina.EcologicalGeneticsandGenomics.2019,12:1-9.