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实用生物信息技术课程期末总结

第一篇：实用生物信息技术课程期末总结实用生物信息技术课程期末总结北京大学生命科学学院2012年8月1日姓名_________学号____________电话____________座位号_____邮箱___________________得分______（按学号为文件名保存为WORD2003文档，如1001210241.DOC，8月20日前发送至[e-mail]）简述你正在进行或准备开始的研究课题的研究背景和科学意义。通过文献阅读、数据库检索，利用序列分析、数据库搜索、结构分析和模拟等各种生物信息学工具，分析你研究课题涉及的蛋白质及其编码基因的序列特征，说明其可能的代谢通路和调控网络，分析或推测其可能的生物学功能；对不同物种中的直系同源基因和同一物种中的旁系同源基因进行系统发育分析，推断该基因家族的起源和演化。以上总结过程中可通过计算机网络进行交流，在交流基础上独立完成上述练习题，严禁互相抄袭。引用文献资料，必须注明出处，严禁照抄网上现有资料。第二篇：“实用生物信息技术”课程总结“实用生物信息技术”课程总结1.收获1）学会了资源搜索。研究生的一个必备工作是读阅读文献，分析文献，但我在文献搜集方面知识比较欠缺，本科的时候使用比较多的是学校图书馆数据库，万方数据库，中国知网等，而对于专业外文文献的搜集并不会。我觉得上实用信息技术课最大的收获是如何搜索自己需要的文献。文献搜索的讲解主要放在第一次课和第二次课。当时就觉得没有白选这门课，这门课的确很实用，作为一个辅助工具辅助我的学习。主要搜索基本可以通过abc主页进入，包括PDB,NBCI,Uniprot等。2）加深了课题认识。除了本科期间做的实验，毕业后我没有参与研究所实验室的实验，这使我对本研究所本团队的研究领域并不清楚，尽管也咨询了师兄师姐但认识仍然比较浅。但在罗老师的严格要求下，通过不断与导师联系，我对本实验室的认识也加深了，对自己将来可能研究的课题有了更进一步的了解，这对于我今后进实验室进行研究有了积极的作用。3）了解了分析工具。在整个课程中，老师讲解了各种蛋白质集基因序列的分析工具，使我倍感受益，以前在课堂上看到的蛋白质结构图，在论文上看到的序列比对分析图，自己也能做出来的时候真的很有成就感，原来未知的知识有这么多。今后我也会继续练习，争取熟练运用老师上课讲的各种工具。这些工具主要有：Weblab分析平台（Emma多序列比对，coderet获取全长基因组的对应序列），Blast数据库相似性搜索，Mega软件的使用，Swiss-PDBviewer蛋白结构比较软件。2.感悟用在学习上再多的时间也不过分。Halfadayonabcsavesamonthinthelab。这句话对我启发很大，有的知识你感觉很难，但是只要肯下功夫，一切难题都会迎刃而解，更何况现在所碰到的根本不是大的难题，而仅仅是因为自己对专业课题的认识不深或者基本知识没有掌握而遇到的问题，这些问题基本上通过查阅文献和阅读使用说明就能够解决的。3.遗憾最遗憾的是自己对自己的课题没有非常深入的了解，仅阅读了几篇文献，因此在课程操作当中，并没有尽善尽美的对自己的课题完成一个深入的报告。4.计划接下来，我会将进一步深入探究自己的课题，利用上课所学知识完成对自身课题的初步研究，以北大同学做的报告为鉴，对自己的课题做一个完美的报告。最后一堂课来的很匆忙，没想到这次竟然是我们实用生物信息技术的最后一堂课，真的舍不得。感觉要学的东西真的刚刚开始，我们这几天的学习在abc无限的资源里面真的是九牛一毛，那么多的Tools，Literature，database我们都还没怎么接触。老师说有些人可能一辈子都用不完。这么多宝贵的资源在这儿，我们怎能浪费。如果不能好好利用这些前人总结下来，创造下来的资源，那真的是太可惜。我觉得能够碰到这样一位教学严谨的老师，是我们莫大的福分。虽然基本操作都会了，但仍然需要认真练习，利用例题同时也利用自己课题的研究对象寻求更好的方法去得到自己想要的结构。当然里面还有很多需要我们继续探讨的操作，这些都需要我们自己在课后补充了。把基础打好了，我相信后面的能够通过努力练习都能熟能生巧。另外，老师在课堂上还讲了很多活生生的例子，以期来警示我们不要为了让结构漂亮而忘记实验的初衷，结构上，最主要的还是要知道它的功能，不能做出来一张漂亮的图片，却不知道每个原子，基团代表什么，不能从图片上读到有用信息就是失败的图片。老师展示了一个同学的关于pymolviewer的PPT，我最喜欢上面的自己做的动画，相信自己也能摸索着做出来用于自己的课题，当然我会在理解其结构基础上再做这些工作。对于老师推荐的一些有用的网站，数据库和工具。比如phyre，protscale，dotlet，AAAAA