猪源致病大肠杆菌耐药性及质粒介导ESBLs耐药基因检测任务书.docx

猪源致病大肠杆菌耐药性及质粒介导ESBLs耐药基因检测任务书
任务名称：猪源致病大肠杆菌耐药性及质粒介导ESBLs耐药基因检测
任务背景：
猪源致病大肠杆菌（PathogenicEscherichiacoli,PEC）引起的疾病在人畜共患病中占有重要地位。PEC可通过传播耐药基因和质粒传输，导致抗生素耐药性的增加，给人畜健康带来严重威胁。因此，了解猪源PEC的耐药性和耐药基因的获取途径对于制定合理的抗生素使用策略和预防耐药性的发展至关重要。
任务目的：
1.了解猪源PEC的耐药性情况；
2.检测猪源PEC中质粒介导的ESBLs耐药基因；
3.分析抗生素耐药性与耐药基因的相关性。
任务内容：
1.猪源PEC耐药性检测：
a.采集一定数量的猪源PEC样本；
b.分离纯化猪源PEC菌株；
c.使用纸片扩散法或测MIC法进行猪源PEC对不同抗生素的敏感性测试；
d.记录猪源PEC对各类抗生素的耐药情况。
2.质粒介导的ESBLs耐药基因检测：
a.提取猪源PEC的基因组DNA；
b.设计引物对ESBLs耐药基因进行PCR扩增；
c.经鉴定为耐药基因阳性的样品进行测序，确认基因类型；
d.根据测序结果设计特异引物进行基因的定量PCR检测。
3.抗生素耐药性与耐药基因相关性分析：
a.对耐药性和耐药基因检测结果进行统计分析，并绘制图表；
b.使用统计学方法（如卡方检验）分析抗生素耐药性与耐药基因的相关性；
c.根据分析结果，提出猪源PEC耐药性的影响因素和防控策略。
任务时间安排：
1.猪源PEC耐药性检测：3天；
2.质粒介导的ESBLs耐药基因检测：5天；
3.抗生素耐药性与耐药基因相关性分析：2天；
4.数据整理、报告撰写和总结：5天。
任务参考文献：
1.MaguireAJ,etal.(2013)Detectionofantimicrobialresistancegenesinisolatedbacteriafromminkfarms.vet.Rec.172(13):339.
2.LiterakI,etal.(2010)AntibioticresistantEscherichiacoliandSalmonellainRussianrooks(Corvusfrugilegus).Vet.Microbiol.140(1-2):110-114.
3.GordonDM,etal.(2012)EpidemicclonalstrainsofEscherichiacoliasacauseofantimicrobial-resistanturinarytractinfectionsinCanada,2002to2004.Antimicrob.AgentsChemother.56(5):2241-2246.
任务要求：
1.检测方法应准确可靠，并在实验过程中保证标本的无污染；
2.实验数据应全部记录，结果应清晰可信；
3.实验过程中需遵循操作规范和安全规范；
4.最终报告应包括实验设计、实验流程、结果分析和结论。
任务考核方式：
1.根据实验结果撰写实验报告，对任务进行总结和分析；
2.在会议上进行报告和答辩，回答相关问题；
3.综合考评实验设计、实验操作、数据处理和报告撰写能力。
任务预期成果：
1.得到一批猪源PEC的耐药性检测结果，并对相关耐药性进行分析；
2.得到一批猪源PEC中质粒介导的ESBLs耐药基因的检测结果，并对基因类型进行鉴定和定量分析；
3.得到抗生素耐药性与耐药基因的相关性结果，并提出相应的防控策略；
4.完成任务报告，提出相关结论，并能够进行相关报告和答辩。
备注：任务所需设备和试剂需根据实际情况自行选择和配备，实验过程中需遵循相关的规范和法律法规。