代谢组学在抑郁症方面的应用.pptx

代谢组学研究的应用癌症、心脏病、心血管疾病是人类健康的三大杀手，随着人类生存压力的增大和生活节奏的变快,抑郁症已成为损害人类健康的第四大疾病，抑郁症的发病率将不断上升，到2020年，抑郁将成为导致人类死亡和伤残的第二大因素实例1抑郁症患者血清代谢物及组学的初步研究为什么用代谢组学研究呢抑郁症患者血清代谢物及组学的初步研究研究对象：选取单胺类神经递质及其代谢产物水平变化显著的样本20例，作为抑郁症患者组，同期健康体检者20例为对照组样品处理
样品处理：从-80℃冰箱取出血清样本，室温下溶化。
取血清100μL，用400μL甲醇提取液抽提后，2500r/m离心5min沉淀蛋白质。
转移含有小分子化合物的上清液100μL至96孔板，转移96孔板用氮吹仪氮气吹干约30min后，再真空冷冻干燥过夜。色谱上样前，用含有质量控制标准物的流动相溶解。（UPLC）
对干燥的样品进行样品衍生化。衍生试剂为N,O-双(三甲基硅烷基)三氟乙酰胺，衍生反应条件为60℃，衍生时间为1小时（GC）对于特定化合物来说,其定性信息就是该化合物的特征谱图和色谱保留时间,是化合物鉴定的基础;
其定量信息就是该化合物的色谱响应强度,如峰高、峰面积,是定量比较不同样品或组别之间差异的基础
由于每分析一个样品都出现大量(通常数百甚至数千个)色谱峰
最终所得到的定量数据都将构成一个的数据集,表第一列为样品名;第一行对应之处为色谱定量数据。
这样每个样品的特征就由同一行中的众多定量数据所决定,而各个样品之间或者各组样品之间差异的程度取决于上述定量数据。
由于数据量非常大,采样常规统计分析方法既难以发现样品之间或各组之间的异同,也难以发现样品中的哪些变量(分子)造成上述差异。因此代谢组学数据需要特殊方法加以分析。

数据规范的标准化处理1红色棱锥代表抑郁症患者组，位于3D图前方，蓝色圆球代表健康对照组，位于图后方.
2血清代谢物分析数据经PCA处理，将多维的数据进行降维，将样本进行分类，可以直观每一个样品在空间中的分布从而了解代谢变化的趋势.
3该模型并不稳定，对抑郁症和对照组的判别率不高，需进行其他多元判别分析。PCA原理OmnisoftArrayStudio软件
1、将抑郁症组和对照组血清代谢物组学检测数据导入SIMCA-P12软件进行PLS-DA分析，采用得分因子作为预测变量线性关系的依据，通过预测变量之间的协方差来建立判别模型。
2、PLS-DA得分矩阵投影散点图
红色方块图标代表对照组，黑色菱形图标代表抑郁症患者组
3、R2Y=0.699，表明69.9％的样本符合该模型判别；Q2=0.447，接近0.5。这些参数说明PLS-DA模型对抑郁症和健康对照组的判别能力较强，但预测力并不高。
方差（StandardDeviation）
用来度量随机变量和其数学期望（即均值）之间的偏离程度

协方差差异化合物的t-检验1用软件MicroLabSTAR®软件绘制箱形图（Box-plot），表达抑郁症患者和健康人血清中代谢物的差异。

2中间方块内的数据为所有数据点的中间50%的数据集，方块上边缘线到最高值线之间的数据是最高的25%，方块下边缘线到最高低线之间的数据是最低的25%。加号是整组数据的平均值，方块里的横线是中值分类相关重要代谢物通路与抑郁症可能的发生发展关系进行分析讨论：结论CUMS动物模型两种药物干预均可以使甘氨酸、琥珀酸盐、酮戊二酸、苯丙氨酸、乌头酸盐和棕榈酸盐6种标志物
回调至正常水平，除此之外，文拉法辛还可以回调核糖和异柠檬酸盐，氟西汀可以回调丙氨酸。展望