计算机辅助药物设计.ppt

计算机辅助药物设计——分子对接及虚拟筛选内容合理药物设计(Rationaldrugdesign，RDD)虚拟筛选（virtualscreening,VS)
也称分子对接，即在进行生物活性筛选之前，在计算机上对化合物分子进行预筛选，以降低实际筛选化合物数目，同时提高先导化合物发现效率。虚拟筛选的效率虚拟筛选技术的分类基于结构虚拟筛选一般流程图分子对接的基本原理分子对接最初思想起源于FisherE.的“锁和钥匙模型”，认为“锁”和“钥匙”的相识别的首要条件是他们在空间形状上要互相匹配分子对接的目的：找到底物分子和受体分子的最佳结合位置目的：
评判配体分子和受体结合能力的强弱。
含义：
①先对同一个分子的不同结合构象，评价各构象的结合好坏。
②再对数据库中的不同分子的最好结合构象进行评价，以得到最终的结合能力从高到低的化合物分子清单。对接方法尚需解决的问题分子对接软件分子对接流程(一)靶点结构的预处理分子对接实例人碳酸酐酶与其抑制剂复合物抗艾滋病药物的发现——虚拟筛选1.HIV-1蛋白酶（HIV-PR）,所催化的水解反应在艾滋病病毒导入人体细胞过程中起着重要的作用2.高效的HIV-PR抑制剂为治疗艾滋病的有效药物3.肽类HIV-PR抑制剂生物性质不稳定，吸收性差，易被代谢分解，因此口服给药无效1.X-射线晶体结构
2.搜寻数据库抗SARS冠状病毒药物的设计——基于SARS-CoV3CL蛋白酶的虚拟筛选SARS-Cov感染宿主细胞起重要作用的结构蛋白3CL蛋白酶作为抗SARS药物筛选靶点的优点步骤1.同源模建结果步骤2.分析酶-配体作用模型步骤3.虚拟筛选步骤4药理测试美普他酚双配体衍生物与AChE的对接研究美普他酚双配体类似物的设计以分子对接证明作用模式对接模型：证明了AChE抑制作用和Aβ聚集抑制作用双配基配体与电鳐TcAChE复合物的单晶X衍射证明：结合方式与对接相似此课件下载可自行编辑修改，供参考！
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