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分子生物学实验总结范文合集

第一篇:分子生物学实验总结分子生物学实验1.TOMY全自动灭菌锅的使用(1)检查排放蒸汽的水壶,腔体内的水位与托板齐平。(2)SET键设置温度和时间(121℃,20min)(3)关闭排气阀,Start机器开始运行,CheckHeat检查设置的温度,Stop键终止机器运行。(4)程序运行结束,旋开排气阀或机器自行排气至压力为0。温度降至80℃以下压力为0时方可开盖。运行过程中勿接触盖子。(5)腔体内经常清洁。2.LB液体培养基(1000mL)将胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠10g完全溶解在950mL去离子水中,用NaOH调节pH至7.0,加入去离子水至总体积为1000mL,121℃湿热灭菌20min。冷却后4℃保存备用。固体还要再加琼脂。3.碱裂解法碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们的。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭合环状质粒DNA的氢键会断裂,但两条互补链彼此缠绕,仍会紧密的结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液,恢复pH至中性时,共价闭合环状质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构。通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。溶液Ⅰ:葡萄糖,Tris-HCl,EDTA葡萄糖能增加溶液的黏度,防止DNA受机械作用而降解。EDTA可螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制DNase对DNA的降解作用。溶液Ⅱ:氢氧化钠,SDS氢氧化钠加入后碱性环境12-12.5促使染色体DNA与质粒的变性解离成单链。SDS是一种阴离子去垢剂,它的主要作用有:①溶解细胞膜上的脂肪与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜;②解聚细胞中的核蛋白,使蛋白质与DNA分开;③SDS能与蛋白质结合成为SDS-蛋白质复合物,使蛋白质变性而沉淀;④SDS能抑制核酸酶的作用,防止对DNA的降解。溶液Ⅲ:乙酸钾。用pH4.2的KAc溶液是为了调整溶液pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。而高盐的3mol/L醋酸钾(KAc)有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白质复合物凝聚而沉淀。4.loadingbuffer电泳指示剂溴酚兰在碱性液体中呈紫兰色,一般与蔗糖、甘油组成上样缓冲液。作用:①增加样品比重,以确保DNA均匀沉入加样孔内。②形成肉眼可见的指示带,预测核酸电泳的速度和位置。③使样品呈色,使加样操作更方便。5.限制性内切酶(I型)限制性内切酶:能识别专一的核苷酸顺序,并在识别点附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的双链,但是切割的核苷酸顺序没有专一性,是随机的。(II型)限制性内切酶:能识别专一的核苷酸顺序,并在该顺序内的固定位置上切割双链。这类限制性内切酶的识别和切割的核苷酸都是专一的,因此,这种限制性内切酶是DNA重组技术中最常用的工具酶之一。(III型)限制性内切酶:也有专一的识别顺序,但不是对称的回文顺序,在识别顺序旁边几个核苷酸对的固定位置上切割双链。但这几个核苷酸对不是特异性的。因此,这种限制性内切酶切割后产生的一定长度DNA片段,具有各种单链末端。因此不能应用于基因克隆。6.引物设计和选择目的DNA序列区域时遵循下列原则:引物长度约为16~30bp;引物中G+C含量通常为40%~60%,可按Tm=4(G+C)+2(A+T)粗略估计引物的解链温度;四种碱基应随机分布,在3’端不存在连续3个G或C,因这样易导致错误;引物3’端最好与目的序列阅读框架中密码子第一或第二位核苷酸对应,以减少由于密码子摆动产生的不配对;在引物内,尤其在3’端应不存在二级结构;两引物之间尤其在3’端不能互补,以防出现引物二聚体,减少产量;引物5’端对扩增特异性影响不大,可引入酶切位点或突变位点;引物不与模板结合位点以外的序列互补;简并引物应选用简并程度低的密码子;引物的浓度一般为0.1~0.5μmol/L,引物浓度偏高会引起错配和非特异性产物扩增,引物浓度偏低则降低产量。7.dNTP常用的浓度为20~200μmol/L,而且4种dNTP的终浓度相等,以减少合成中由于某种dNTP的不足而出现的错误掺入;dNTP浓度过高虽可加快反应速度,但会增加碱基的错误掺入率,同时会抑制TaqDNA聚合酶的反应活性;适当的低浓度会提高反应的精确度;注意协调Mg2+浓度和dNTP浓度之间的关系。8.感受态处于对数生长期的细菌经低温CaCl2处理后接受外源DNA的能力显著增加。细菌处于容易吸收外源DNA的状态叫感受态。在自然条件下,很多质粒都可通过细菌接
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