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化学生物学总结

第一篇：化学生物学总结蛋白质：是由许多氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物。肽键形成原理：多肽的合成就是形成肽键的过程，即一个氨基酸（AA）氨基亲核进攻另一个氨基酸被活化的羧基部分，形成肽键。化学合成多肽方法：液相多肽合成，固相多肽合成，环肽合成固相多肽合成步骤：多肽的C端氨基酸通过linker键连到树脂上；脱除氨基上的临时保护基；与下一个氨基酸缩合；反复进行脱保护盒缩合；脱除半永久性保护基；表达蛋白连接及其优点：利用蛋白剪接技术，通过硫醇解离适当的突变蛋白—内含肽融合体，生成重组蛋白硫酯之后用于半合成形式的自然化学连接。优点：为蛋白质翻译后修饰提供良好方法，可以引入非天然氨基酸。DNA复性：在适当条件下，变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象，这一现象称为复性。核酶：有催化功能的RNA分子，参与RNA及其前体的加工和成熟过程。肽核酸：一类以中性酰胺键为骨架取代糖磷酸主链的DNA类似物。核酸适体：一类有三维空间结构的单链核酸小分子，与特异靶分子相结合,对靶标分子识别有高度专一性和强亲和力，调节靶标分子的功能。核酸适体：荧光修饰的适体用于药物分子的高通量筛选。本身可作为药物，适体可作为肿瘤生长过程中的重要功能蛋白质的直接抑制剂；用于抑制癌症的相关靶蛋白；用于肿瘤分子成像及肿瘤相关蛋白检测核小体：用于包装染色质的结构单位，是由DNA链缠绕一个组蛋白核构成的。由DNA分子和组蛋白组成核苷酸：由戊糖，碱基，磷酸组成Trna：二级结构：三叶草形；三级结构：“L”形rRNA的种类：真核生物5SrRNA，28SrRNA，5.8SrRNA，18SrRNA；原核生物5SrRNA，23SrRNA，16SrRNA常用的核酸体外合成技术：核酸的PCR合成技术；核酸的固相合成技术RNA干扰：dsRNA被内切核酸酶Dicer切割成小片段RNA（21-23bp）siRNA和酶形成RISC沉默复合物，然后特异性识别并切割mRNA，之后断裂的mRNA被降解天然单糖：D-型蛋白聚糖是一条或多条糖胺聚糖以共价键与核心蛋白形成的大分子糖复合物化合物。糖缀合物：单糖、寡糖或多糖与蛋白质和脂质连接形成糖缀合物。包括糖蛋白和糖脂。糖的保护基满足的条件：便宜、稳定、无毒，引入条件适合；反应过程中稳定；脱除高效且条件条件温和；脱除后，易与产物分离。保护基的正交性：同时存在多种保护基时，脱除一种不对其他产生影响。寡糖的合成方法：液相合成：收敛式合成，线性合成，双向合成，“一锅法”；固相合成；酶促寡糖合成糖序列分析方法：酶法分析N-连接寡糖结构；采用凝集素分离、分析寡糖和糖缀合物；质谱MS和核磁共振NMR测定结构。糖生物学主要研究内容：糖的结构，合成，与蛋白质的相互作用，序列分析和糖组学。初级代谢物：指生物通过代谢活动所产生的、自身生长和繁殖所必需的物质物质。如氨基酸、核苷酸、多糖、脂类、维生素等脂类化合物功能：存储能量；作为细胞膜的组成成分；信号分子生产方法辅酶Q10全合成法：全合成法；微生物发酵法；醇一碱皂化制造法非核糖体合成多肽：从多种生物体内分离出的含有N-甲基化骨架和非天然氨基酸的天然多肽类化合物。不由核糖体合成，不需要mRNA模板，由非核糖体多肽合成酶而来小分子的优势：易实现时间上的精确控制；与大分子的作用可逆；药物学剂量容易控制；可应用于多种类型的有机体和生物体；作为探针研究细胞靶蛋白的功能。物质跨膜运输：方式：被动运输、主动运输、胞吞胞吐作用机制:离子载体、离子通道、离子泵趋磁细菌：一类在外磁场的作用下能作定向运动并在体内形成纳米磁性颗粒－磁小体的细菌。金属化合物药物的缺点：毒性大；副作用强；易产生耐药性仿生金属催化研究内容：根据生物催化剂的结构特征，设计和化学方法合成具有催化功能的模拟酶；研究这些模拟酶的催化机理、催化工艺、构效关系。单核苷酸多态性(SNP)：指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C,G)的变异所引起的DNA序列多态性荧光原位杂交的基本原理：用已知的标记单链核酸为探针，按照碱基互补的原则，与样品染色体中未知的单链核酸进行异性结合，形成可被检测的杂交双链核酸。转录组学：在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科，从RNA水平研究基因表达的情况蛋白质组：指的一个细胞或生物体所有蛋白质的总和。蛋白质组学：是对蛋白质组的大规模和系统性的分析，在蛋白质水平上定量、动态、整体性地研究生物体。肽质量指纹图谱：蛋白质被识别特异酶切位点的蛋白酶水解后得到的肽片段的质量图谱。双向电泳步骤：第一向等电聚焦，第二向SDS-PAGE电泳蛋白质结构解析：X射线晶体学；核磁共振技术噬菌体展示：将外源基因的DNA分子群与噬菌体外壳蛋白基因相连接，使外源DNA所编码的蛋白质以融合蛋白形式表达在噬菌体外壳表面的方法。正向化学遗传学：