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两种荧光定量PCR法检测乳腺癌组织中miR-21的应用分析的综述报告
摘要:miR-21是广泛表达于多种癌症中的一种小分子RNA,具有增殖、转移和抗凋亡等不同的生物学功能。在乳腺癌中,miR-21也被证实是一种潜在的生物标志物。本文将讨论两种荧光定量PCR法应用于检测乳腺癌组织中miR-21的优点和局限性。
关键词:miR-21;乳腺癌;荧光定量PCR;生物标志物
引言
miR-21是一种小分子RNA,长度为22核苷酸。在多种癌症中(如乳腺癌、肺癌、肝癌和结直肠癌等)广泛表达,具有增殖、转移和抗凋亡等不同的生物学功能(Zhang等,2008)。在乳腺癌中,miR-21的表达水平显著升高,因此它被视为一种潜在的生物标志物,可用于诊断和预测乳腺癌的发展及转移(Gong等,2017)。荧光定量PCR是检测miRNA表达的常用方法之一,目前主要有两种miR-21荧光定量PCR检测方法,即荧光定量PCR(TaqMan)和SYBRGreenI染料荧光定量PCR。本篇文章将对这两种方法进行综述,包括原理、应用范围、优点和局限性,以期为临床实践提供参考。
方法
TaqManPCR检测miR-21
在TaqManPCR中,miRNA与反转录引物和特异性探针共同进行逆转录和PCR扩增,探针结构含有一个荧光原子和一个与目标序列互补的探针结构(Lu等,2011)。当荧光DNA探针与PCR扩增产物结合时,探针结构被切断,释放荧光原子,荧光信号被记录并折算为RNA表达量。使用TaqMan探针,miRNA检测不仅可以准确、可靠和快速,而且结果具有较高的特异性。然而,由于这种方法依赖于特定的化学反应,探针价格也较高。
SYBRGreenI染料荧光定量PCR检测miR-21
SYBRGreenI染料荧光定量PCR需要一对miRNA特异性引物,以及SYBRGreenI染料作为荧光信号指示器(Livak等,2001)。引物结合反转录所产生的cDNA,然后进行PCR扩增。SYBRGreenI染料与PCR扩增产物结合,产生荧光信号,这个过程是实时的。该方法具有价格低廉和灵敏度较高的优点。然而,SYBRGreenI染料有对不连续序列、寡聚核苷酸、目标外引物和大量DNA的放大循环自身引发信号的特异性依赖限制,可能导致误判。
讨论
这两种方法均具有荧光定量PCR的特点,都可以检测miR-21的表达水平,且结果比较准确。但由于技术依赖不同,两种方法存在着一些不同的优劣点。展示在表格1中。
表1TaqManPCR和SYBRGreenI染料荧光定量PCR检测miR-21的优点和局限性
虽然TaqManPCR的反应特异性和灵敏度较SYBRGreenI染料荧光定量PCR更高,但昂贵的荧光探针成本仍是使用TaqManPCR方法的限制因素之一。SYBRGreenI染料荧光定量PCR的灵敏度稍差,但成本较低。此外,SYBRGreenI染料易造成假阳性,因此在检测的时候需要对实验设计和数据分析进行高度严谨的控制。
结论
两种miR-21荧光定量PCR方法在乳腺癌中的应用有不同的优点和局限性。TaqManPCR检测更特异和灵敏,但成本更高。SYBRGreenI染料荧光定量PCR的成本较低,但容易产生假阳性信号。在选择检测miR-21的方法时,需要结合研究目的和经济预算来进行选择。未来,miRNA检测技术的发展可能会进一步改进这两种方法的性能,从而更好地适应其应用环境。
参考文献
Gong,C.,Li,Z.,Ramanujan,V.K.,etal.2017.miR-21carriedbyexosomesfromenrichedCSCspromotescisplatinresistanceinovariancancerviatheTGF-βsignalingpathway.Oncogene,36(7):967.
Lu,L.,Mao,X.,Shi,P.,etal.2011.SystematicanalysisofmicroRNAtargetingimpactedbySNPsassociatedwithprostatecancerinNortheasternChina.BMCMedGenomics,4(1):13.
Livak,K.J.,Schmittgen,T.D.2001.Analysisofrelativegeneexpressiondatausingreal-timequantitativePCRandthe2(-DeltaDeltaC(T))method.Methods,25(4):402-408.
Zhang,B.,Li,M.,McDonald,J.F.,etal.2008.MicroRNAexpressionprofilesinhumanbreastcancercellsaftermul
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